Сюжет аниме сосредоточен на действиях профессионального вора Арсена Люпена III. Его целью становится дневник, содержащий информацию, связанную с событиями Второй мировой войны. Документ защищен сложной системой шифров, для вскрытия которой требуются специфические навыки.