Покемон: Современное поколение — Лукарио и загадка Мью

Действие аниме разворачивается в Японии, начиная с 1990-х годов, и охватывает более десяти лет жизни главного героя, Такаки Тоно. Сюжет разделен на три части, каждая из которых посвящена разным периодам его жизни и его отношениям. Первая часть, "Отрывок о цветущей сакуре", начинается в 1994 году, когда Тоно учится в младших классах школы и знакомится с девочкой по имени Акари.

Из-за переезда семьи Акари в другой город они вынуждены расстаться, но продолжают общаться письмами и изредка встречаться. Через год Тоно решает передать Акари письмо с признанием в чувствах. При встрече происходит их первый поцелуй, письмо теряется, и после этого их пути окончательно расходятся. Вторая часть, "Космонавт", повествует о жизни Тоно в средней школе на другом острове, где в него влюбляется одноклассница Канаэ Сумида, которая несколько лет хранит свои чувства в тайне.

В выпускном классе Канаэ решается признаться Тоно в любви. Третья часть, "5 сантиметров в секунду", показывает Тоно уже взрослым, работающим человеком. После расставания с девушкой, с которой у него были долгие отношения, он теряет интерес к работе и смысл жизни. Во время одной из прогулок по городу он случайно встречает Акари, свою первую любовь.